Причинами болезней растений являются грибы, нематоды, бактерии и вирусы. Для борьбы с болезнями, вызванными этими патогенами, обычно требуется сочетание различных мер. Помимо биологических и химических пестицидов, большое значение имеют такие факторы, как выбор сорта и места, севооборот и методы выращивания.
Фитопатологи не только проводят исследования в области мониторинга болезней и вредителей, диагностики заболеваний и тестирования селекционного материала, но и занимаются разработкой и созданием новых тестов и методов, а также защитой сельскохозяйственных культур в теплицах и на полях.